El cloruro de sodio es ampliamente utilizado en la investigación bioquímica y de biología molecular. Se utiliza para la eliminación de pequeños fragmentos de ácido nucleico de las preparaciones de ADN plasmídico y la precipitación de ADN de muestras que contienen SDS. También se ha descrito su uso en protocolos de aislamiento de ADN de células de mamíferos cultivadas en placas de múltiples pozos y muestras de tejido de mamíferos pequeños. El cloruro de sodio también se utiliza en la secuenciación química de ADN.